Τον Αύγουστο και τον Σεπτέμβριο (2009), κλιμάκια της Ύπατης Αρμοστείας του ΟΗΕ για τους Πρόσφυγες και του έλληνα Συνηγόρου για τα Δικαιώματα του Παιδιού, επισκέφτηκαν το κέντρο κράτησης αλλοδαπών στην Παγανή της Λέσβου και δήλωσαν σοκαρισμένοι από τις συνθήκες που επικρατούσαν. Περισσότεροι από 850 άνθρωποι, μεταξύ των οποίων και 200 ασυνόδευτα παιδιά, κυρίως από το Αφγανιστάν, ήταν στοιβαγμένοι σε ένα χώρο που δεν μπορεί να δεχτεί παραπάνω από 250 – 300 άτομα. Η Ύπατη Αρμοστεία περιέγραψε την κατάσταση ως «απαράδεκτη» και «προσβλητική για την ανθρώπινη αξιοπρέπεια». Ο Συνήγορος του Παιδιού διαπίστωσε ότι ενώ είχε ήδη ξεκινήσει η μεταφορά ανηλίκων σε κέντρα φιλοξενίας και η απελευθέρωση ενηλίκων, οι συνθήκες κράτησης των 77 ασυνόδευτων ανηλίκων που παρέμεναν στο Κέντρο εξακολουθούσαν να είναι άκρως προβληματικές. Επιπλέον, η Ύπατη Αρμοστεία του ΟΗΕ για τους Πρόσφυγες διαπιστώνει ότι οι θεσμικές αλλαγές που υιοθετήθηκαν με το Προεδρικό Διάταγμα 81/2009 δεν εξασφαλίζουν επαρκώς μια δίκαιη και αποτελεσματική διαδικασία αναγνώρισης του καθεστώτος του πρόσφυγα στην Ελλάδα σύμφωνα με τη διεθνή και ευρωπαϊκή νομοθεσία.